Цитата: что бух учет ведется с применением плана счетов и инструкции по его применению,
Здравствуйте. Обратимся к НПА:
II. Формирование учетной политики
4. Учетная политика организации формируется главным бухгалтером или иным лицом, на которое в соответствии с законодательством Российской Федерации возложено ведение бухгалтерского учета организации, на основе настоящего Положения и утверждается руководителем организации.
При этом утверждаются:
рабочий план счетов бухгалтерского учета, содержащий синтетические и аналитические счета, необходимые для ведения бухгалтерского учета в соответствии с требованиями своевременности и полноты учета и отчетности;
ПРИКАЗ, ПБУ МИНФИНА РОССИИ от 06.10.2008 №№ 106н, ПБУ1/2008, ПБУ21/2008
То есть я это понимаю так, что в Приложении № 1 к УП нужно указать те счета которые вы применяете в учете и исключить те, которые не применяете.